机关单位对不明确事项应当采取的正确做法是：
一、遵循法定程序，依法处理
机关单位在面对不明确事项时，应依法依规处理，不能擅自决定或做出错误判断。具体做法包括：
- 明确责任主体：明确责任部门或人员，确保事项有专人负责。
- 征求意见：在不明确的情况下，应征求相关职能部门、专家、法律顾问等的意见。
- 书面报告：对不明确事项应及时向上级部门或主管部门报告，说明情况、理由和建议。
二、坚持实事求是，避免主观臆断
机关单位在处理不明确事项时，应坚持实事求是的原则，避免主观臆断或滥用职权。
- 不随意表态：对不明确事项不得擅自表态或做出决定。
- 不越权处理：不得超越职权范围处理不明确事项。
- 不推诿拖延：不得推诿责任，应依法依规推进工作。
三、加强沟通协调，形成合力
- 加强信息沟通：及时与相关单位、部门沟通，确保信息准确、及时。
- 协调联动：必要时协调其他部门共同处理不明确事项。
- 建立机制：建立不明确事项处理机制，确保有章可循、有据可依。
四、注重程序规范，确保合法性
- 遵循法定程序：处理不明确事项必须按照法定程序进行。
- 程序合法：包括但不限于：征求意见、审查、论证、听证、公示等。
- 文书规范：处理结果应以正式文件形式发布，确保程序合法、内容合规。
五、加强监督问责，确保落实
- 加强内部监督：对不明确事项的处理过程和结果进行监督，防止滥用职权。
- 落实责任追究：对因不明确事项导致的问题，应追究相关责任人的责任。
- 接受社会监督：对不明确事项的处理结果，应主动接受社会监督，提高透明度。
总结
机关单位对不明确事项的正确做法是：
依法依规、实事求是、程序规范、注重沟通、强化监督，确保事项处理合法、公正、有效。
如需进一步了解某类不明确事项的处理流程或具体案例，也可以继续提问。